非常にスポーツの盛んな高校が多く、特に高校野球に関しては甲子園常連校が多いのが特徴。
（中高）神奈川・横浜市港北区【共】
（中高）東京・文京区大塚【男】
（中高）東京・板橋区【女】
＊日本大学附属校の中での唯一の女子校。
（中高）東京・目黒区【共】
＊日出中学校・高等学校が２０１９年より日本大学の付属校へ。同時に校名も変更。
＊５０年ぶりに日本大学の付属校が誕生
（中高）静岡・三島【共】
（中高）神奈川・藤沢【共】
＊中学校は2009年春開校
（中高）山形・山形市【共】
（中高）東京・墨田区【共】
（中高）千葉・船橋市【共】
＊千葉日本大学第一小学校
千葉県船橋市【共】
（中高）東京・杉並区【共】
（中高）東京・町田市【共】
（中高）北海道・北広島市【共】
（中高）栃木・佐野市【共】
（中高）茨城・土浦市小松ケ丘町【共】
＊土浦日本大学中等教育学校
（中高）茨城・土浦市小松ヶ丘町【共】
（中高）長野・長野市【共】
（中高）長崎・諫早市【共】
（中高）宮崎・宮崎市【共】
（高）東京・世田谷区桜上水【共】
（高）東京・杉並区和泉【共】
（高）福島・郡山市【共】
（高）千葉・船橋市【共】
（高）山梨・上野原市【共】
（高）茨城・桜川市【共】
（高）岐阜・大垣市【共】
（中高）文京区白山二丁目【共】
＊2015年4月1日より校名を「京北中学校・高等学校」から今の校名に変更。とともに男子校から共学に。
校舎は東洋大学白山第2キャンパス跡地。
併設型中高一貫教育を行う。
（高）茨城・牛久市【共】
＊2015年4月1日東洋大学附属牛久中学校開校。
2015年4月1日からの中学校開校に伴い中高一貫教育を提供。
東洋大学附属牛久高等学校は、中学校から入学した内部進学の生徒と高等学校から入学した外部進学の生徒との間で別々にクラスを編成する併設型中高一貫校に。
中学校第2学年までに、中学校の学習内容の全課程を終え、中学校第3学年から、高等学校の授業内容に入るとされる。
（高）兵庫・姫路市【共】
＊2014年4月1日東洋大学附属姫路中学校開校。
東洋大学附属牛久高等学校は、中学校から入学した内部進学の生徒と高等学校から入学した外部進学の生徒との間で別々にクラスを編成する併設型中高一貫校に。
中学校第2学年までに、中学校の学習内容の全課程を終え、中学校第3学年から、高等学校の授業内容に入るとされる。
いずれも実質上は系列校。専修大学への進学率も必ずしも100％ではない。
（高）東京・杉並区【共】
（中高）千葉・松戸市【共】
＊専修大学松戸幼稚園
（幼）千葉・松戸市
（高）岩手・北上市【共】
（高）熊本・玉名市【共】